تأوي الجمعية ما يزيد على 200 يتيم ويتيمة في بيت الخليل للأيتام وبيت الخليل الخيري لليتيمات، وتسعى على تنشئتهم تنشئةً أخلاقية سويةً وفق تعاليم ديننا الحنيف، إضافة إلى إشباع حاجاتهم المعيشية الأساسية من مأكل ومشرب وملبس، إلى جانب الرعاية الصحية والنفسية لهذه الشريحة، ويعنى بإيواء الأطفال ذوي الظروف الاجتماعية الصعبة(الأيتام، الحالات الاجتماعية – طفل محتاج، يتيم أم) والقيام برعايتهم تربوياً واجتماعياً ونفسياً، ويتمثل هذا البرنامج ببيوت الإيواء المحتضنة لمجموعة من المستفيدين من المشاريع التي تقدمها الجمعية بشكل مستدام، إذ أن جميع المستفيدين من هذا البرنامج يمثلون جزءاً من طلبة المدارس التابعة للجمعية الأم